המכללה האקדמית אשקלון נמנית עם עשרים ושתיים מכללות ציבוריות שזוכות לתמיכה של המועצה להשכלה גבוהה (מל"ג). המכללה כפופה להוראות הכוללות קביעת שכר לימוד אחיד במכללות הציבוריות ובאוניברסיטאות.