תוכנית הלימודים לתואר שני בעבודה סוציאלית רפואית נועדה להעמיק את הידע המקצועי והאקדמי של עובדים סוציאליים במערכת הבריאות, תוך שילוב בין תיאוריה, מחקר ופרקטיקה. התוכנית מדגישה למידה אינטגרטיבית, פיתוח מיומנויות טיפול, ניהול ומחקר, וראייה מערכתית של תחומי הבריאות, הגוף והנפש.